Con la Risposta all’istanza di interpello n. 171 dell’11 settembre 2026, l’Agenzia delle Entrate ha fornito chiarimenti in merito al trattamento fiscale ai fini delle imposte dirette, dell'IVA e delle imposte di registro, ipotecaria e catastale di una fusione per incorporazione di una società semplice in una fondazione ente del Terzo Settore.

In particolare, è stato precisato quanto segue:

  1. qualora anche dopo l'operazione di fusione, i beni compresi nella società semplice (nella fattispecie, un’azienda agricola) continuino a farne parte e ad essere effettivamente utilizzati, anche in via indiretta dall'affittuario, per l'esercizio dell'attività agricola, le eventuali plusvalenze relative a tali beni, “'trasferiti”' dalla società semplice alla fondazione (ente incorporante) per effetto della fusione, non assumeranno rilevanza reddituale ai sensi dell'art. 67 del Tuir (in tal senso l’Agenzia delle Entrate richiama la Risposta all’istanza di interpello n. 555/2022). In capo alla fondazione, tali beni conserveranno il medesimo costo fiscalmente riconosciuto che avevano in capo alla società semplice;
  2. se, come avvenuto nel caso sottoposto alle Entrate, al momento della fusione la società semplice ha concesso interamente in affitto l'azienda e non svolge più alcuna attività agricola, la fusione sarà fuori campo Iva per carenza del presupposto soggettivo in capo alla società semplice (Risoluzione 23 novembre 2007, n. 340/E);
  3. considerato infine che la fusione per incorporazione della società semplice nella fondazione è posta in essere da un ETS che, all'esito dell'operazione, continuerà a mantenere la qualifica di ente del Terzo Settore iscritto al RUNTS, si applicano l'imposta di registro, l'imposta ipotecaria e l'imposta catastale in misura fissa, ai sensi dell'art. 82, comma 3, del Codice del Terzo Settore.

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